Als kind kregen Erasmus en zijn broer Pieter les aan de parochieschool, ook wel de Latijnse school genoemd. De school werd in 1407 gebouwd op de plek waar in de 19e eeuw het gebouw Arti Legi verrees. Leermeester van beide jongens was hun oom Pieter Winckel. De ouders van Erasmus besloten dat hun zonen beter af waren op een andere school en stuurden hen naar de hoog aangeschreven Lebuïnusschool in Deventer. Hun moeder Margaretha ging met de jongens mee.